Endosymbiyoz, birinin diğerinin içinde yaşadığı türler arasındaki bir birleşmedir. Bazı bakterilerle orijinal simbiyozlarından türetilen kloroplastlar ve mitokondri gibi ökaryotik hücrelerin belirli organelleri. Endosimbiyoz sürecinde, simbiyotik eleman, konağın hücre içi alanında yaşar. Bu örneklere bir örnek: bazı mercanların hücrelerinde yaşayan bir alg türü olan zooxanthellae'dir.
Endosimbiyotik teori, bir ökaryotik hücrenin, her ikisinin de fayda sağladığı bir birlikte varoluşu sürdürmek için kendisini diğerine bağlama yeteneğine sahip olduğunu, çünkü konakçının endosimbiyotik tarafından salınan meyvenin tadını çıkaracağını belirtir. Öte yandan, bu teori aynı zamanda, evrimleşen ilk organellerin mitokondri olduğunu ve daha sonra seri endosimbiyoz yoluyla ataların ökaryotik korpüskülünün fotosentez yapabilen bir endosimbiyon elde ettiğini ve daha sonra gelecek ökaryotik hücresel organelleri geliştireceğini doğrulamaktadır. ilk yeşil alglerin ne olduğunu üretmek için.
Mitokondri ve plastidlerin endosimbiyoz sürecinden doğduğuna dair bazı kanıtlar vardır, bunlardan biri, bazı bakterilere benzer olan mitokondri boyutudur. Hem kloroplastlar hem de mitokondri, kovalent olarak kapalı dairesel çift sarmallı DNA'dan oluşur. Çift kumaşla kaplanmıştır. Kloroplastlar ve mitokondri, prokaryotlar gibi ikili bölünme ile bölünür. Hem mitokondride hem de kloroplastlarda protein sentezi bağımsızdır.